Pendant la guerre civile en Amérique, un groupe de cinq personnes et d’un chien s’enfuient en ballon dirigeable de la ville de Richmond, alors assiégée. Un ouragan les emporte jusque dans une île lointaine et déserte. Leurs seuls biens : un couteau, une montre et un cahier …
Mais les nouveaux arrivés découvrent bientôt que sur l’île règne un mystérieux et puissant maître qui secrètement les aide et les protège. Finalement, il s’avère que ce maître est le capitaine Nemo...