Konstantin Khabenski est né le 11 janvier 1972 à Léningrad (Saint-Pétersbourg). Il fait d'abord des études dans une école technique puis en 1990 entre à l'Institut du théâtre de la musique et du cinéma (LGITMiK) où il est l'élève de V.M. Filchtinski. Tout en faisant ses études il inteprète plusieurs rôles : Lomov dans le vaudeville Les farces de Tchekhov (Шутки Чехова), plusieurs personnages dans la mise en scène de Le temps de Vyssotski et le rôle de Tcheboutykine dans Les trois soeurs de Tchekhov. Pour son diplôme de fin d'études, il interprète Estragon dans la mise en scène de En attendant Godot réalisée par Poutoussova.
Sa première intervention au cinéma est dans le film Qui Dieu va-t-il choisir ? (На кого Бог пошлёт) de Vladimir Zaïkine. En 1995 et 1996 Konstantin Khabenski travaille dans le théâtre expérimental Perekrestok et à la télévision régionale en qualité de responsable d'émissions d'informations et d'émissions musicales. En 1996 il joue dans le théâtre satyrique Raïkine, en particulier dans Cyrano de Bergerac et en même temps interprète un rôle dans le film Khroustialiov, ma voiture (Хрусталёв, машину!) de Alekseï Guerman.
En 1997 il devient célèbre grâce à ses rôles dans le film Natacha du réalisateur hongrois Tomach Tout et dans La Maison pour les riches (Дом для богатых) de Vladimir Fokine.
En 1998 au festival Littérature et cinéma (Литература и кино) de Saint-Pétersbourg il est désigné meilleur acteur pour son interprétation dans La Maison pour les riches. En 1999 Konstantin Khabenski commence la série télévisée La Force de choc (Убойная сила) et tourne dans le film Les particularités de la politique nationale (Особенности национальной политики) de Dmitri Meskhiev. En 2000 il joue dans les séries télévisées Agent de la sûreté nationale (Агент национальной безопасности) et L'Empire sous le choc (Империя под ударом) mais continue en même temps sa carrière théâtrale en participant au spectacle La mort de Tarelkine (2001) et La chasse aux canards au MXAT (2002).
En 2001 il tourne dans le film La Suite mécanique (Механическая сюита) de Dmitri Meskhiev et dans En mouvement de Philip Yankovski. En 2002 il tourne dans le film Les Lignes du destin (Линии судьбы) de Dmitri Meskhiev En 2003 il tourne dans Night Watch (Ночной дозор) de Timour Bekmambetov et dans Les Nôtres (Свои) de Dmitri Meskhiev.
En 2004 il tourne dans Le Conseiller d'État (Статский Советник) de Filipp Yankovski il joue en même temps au théâtre au MXAT dans La Garde blanche (Белая гвардия) de Boulgakov.